简单的概括来说，只有少数婴儿期发现的、尺寸在0.5mm以下的先天性房间隔缺损、室间隔缺损有自愈的可能。即使尺寸在0.5mm以下的先天性房间隔缺损、室间隔缺损对身体影响不是很大，但是，由于这两类疾病有不同的并发症和对身体潜在的影响，比如小房缺可能会有两个罕见的并发症，即矛盾血栓和脑脓肿，这些好发于成年继发孔型房缺病人，尤其是60岁以后，由感冒等感染引发并加重，故即使小时不治疗，现在主张到成年人很小的房缺也要介入治疗。部分小的室间隔缺损也是在小孩反复感冒发烧、血流冲击三尖瓣结构或室缺边缘，导致心内膜增生而逐渐关闭室缺，也就是说是冒着小孩患感染性心内膜炎的风险来换得的“自愈”。因此，对于这些患者，所有的医生都认为应该定期复查心脏超声，了解缺损动态的变化，如果稳定或缩小，则等待“自愈”，如果扩大，出现X线下心脏扩大，肺充血等，应选择体质较佳、家属方便的时期手术。

有科学报告发现，房缺直径大于1.0 cm、腔静脉窦型房缺、右室增大及6岁以上的房缺自然愈合机会很小

巨大的室间隔缺损，25％-50％在1岁内因肺炎、心力衰竭而死亡。因此，心力衰竭反复发作婴儿应行缺损修补治疗。约半数小缺损可能自行闭合，除并发细菌性心内膜炎外，可观察到10岁再考虑手术治疗。很小的缺损可终生不需手术。分流量超过50％或伴有肺动脉压力增高的婴幼儿应早日手术，以防肺高压持续上升。巨大膜周型或漏斗部缺损，尤其是双动脉瓣下缺损（干下型，I型，嵴下型、流出道型），应在2岁心以前根治，以防主动脉瓣脱垂的发生，引起主动脉瓣返流或者衰坏，而需要手术更换机械瓣膜。

目前小儿先心病常用的治疗方式有:

    主要的治疗措施有外科手术和内科介入，目前没有促进缺损愈合的药物。外科手术根据各医院或医生的技术特点有不同的开刀方式，常规正中开胸的房间隔缺损修补手术是极安全的，目前熟练的医院并发症可以降低到接近于0。室间隔缺损的修补发生死亡等严重手术风险可以接近1‰。近年来开展的外科微创治疗对技术要求高，右侧胸部切口（又叫侧切口，有人还分沿肋骨的弧形和腋下直切口）不少医生的成功经验接近常规手术，不过专业杂志上也没有超过500例连续成功的治疗经验报道，从理论上来讲，总的风险要高于正中开胸的手术，由于切口小，手术创伤小、切口美观，受到少数患者的青睐，医生应该慎重施行。

对于部分适合的患者，还可以用胸部正中下段切口，只有常规切口的一半大小，一般切口上端不超过衬衣的第二个扣子，如果这种切口既兼顾美观，又保证风险不会提高，可以用于大多数的房间隔缺损和室间隔缺损，即使术中有风险或发现未诊断准确的疾病，也可以延长为常规的切口。

目前外科技术的发展，可以采取3到5公分的小切口，借用介入封堵的器械，封堵缺损，也是一种新的尝试。我院以上微创开展较多，已有数百例成功经验。总之，小切口手术的特点是切口美观、瘾蔽、创伤小、出血少、恢复快、愈合好、畸形少、费用少等。但是对于病情复杂患者，或肥胖及扁平胸的成年人，一定要根据病情及医生的意见慎重选择。

介入治疗小儿先天性心脏病目前有一定的局限性，首先，介入操作在小于2岁的小孩很难进行，手术后风险也高的多，一般的医院都避免在小儿中使用该项技术。根据2008年全国心血管病介入论坛18家医院汇总的结果表明，先心病介入治疗36,072例，平均并发症发生率达4.45％，涉及1600多人。2007年根据15家医学中心统计完成6822例各类先心病介入治疗，其中并发症患者达204人，主要是心律失常（LBBB,RBBB,II～III°AVB,AF），1.8%，平均1.5%需要安装永久起搏器，封堵器脱落0.2%，死亡0.05%，因封堵伞引起的血栓脑卒中发生也达0.05%。有1‰的患者需要转为外科手术。因此对于小孩而言，介入风险要高于外科手术。国内学者认为小于5岁的室缺患儿封堵术后易并发Ⅲ°AVB。这是由于儿童心肌纤维发育相对薄弱，窦房结功能发育不完善，房室束发育纤细，容易受到损伤，封堵术后发生III度AVB的几率更高。所以美国FDA只批准了肌部室间隔缺损的封堵，对小儿先天性室间隔缺损的封堵是禁止的，房缺的封堵也是限制在中央型。